Обладает сильными антисептическими свойствами. Оказывает губительное воздействия на бактерии стафилококки, стрептококки, дизентерии, ограничивает рост трихомонад, эшерихий, бактерий, вызывающих заболевание туберкулёзом. Является отпугивающим средством для москитов и комаров.

Может применяться самостоятельно или в сочетании с эфирными маслами из мяты, шалфея, лаванды для ингаляционных процедур, ароматерапии, принятия лечебных ванн. Эвкалиптовым маслом лечат флегмон, поражения слизистой оболочки, вызывающие эрозии и язвы, фурункулёзы, радикулиты. Используется при ожогах и повреждениях глаз, сопровождающихся поражением инфекцией.

В народной медицине эфирное масло из эвкалипта нашло применение как наружное антисептическое средство, используемое для излечение рака прямой кишки и молочной железы.